Leonor se casaría con Hércules I de Este, su parece ser, segundo marido.

Dos sobrinos de Rodrigo Borgia, entonces cardenal, estaban allí para recibirla[4]​ ya que querían causarle una buena y duradera impresión.

"Los tesoros de la Iglesia, están siendo utilizados para tales usos", escribió asombrada.

Debido al hecho de que su madre y su hermana, Beatriz, a la que también amaba profundamente, murieron jóvenes, veía el matrimonio como un mero deber doloroso, viendo a su novia, Lucrecia, con poco interés.

[6]​ Debido a su poder, fue una figura importante y con trascendencias En ella se inspiraron obras como Del modo di regere et di regnare, de Antonio Cornazzano, que se la dedicó[2]​ Era una escritora elocuente y mostraba una gran habilidad política en su correspondencia.