Realiza un recorrido similar al de las líneas 102 (entre Atocha y Méndez Álvaro), 148 (entre Méndez Álvaro y Legazpi), 59 (entre Legazpi y San Cristóbal) y 23 (en su desvío por El Espinillo) La línea, al igual que todas las líneas nocturnas de Madrid de la red de búhos, empieza su camino en la plaza de Cibeles y sus horarios de salida de la misma coinciden con los de otras líneas para permitir el transbordo.
Esta línea circula hasta San Cristóbal.
La entonces línea N10 Plaza de Cibeles-Colonia San Cristóbal de los Ángeles realizaba el recorrido actual de la N13 sin pasar por Méndez Álvaro y teniendo un recorrido en ambos sentidos en el barrio de Villaverde Bajo.
Adoptó su actual recorrido y cabeceras en octubre de 2002 con la ampliación de la red nocturna de 20 a 24 líneas.
Desde su anterior denominación de N10 en 1994 hasta mayo de 2017 la línea circulaba por el Paseo de las Delicias y la calle Batalla del Salado, hasta que fue modificado su recorrido para prestar servicio al barrio del Planetario, pasando previamente por Méndez Álvaro.