Dado que las condiciones durante la Guerra del Pacífico se deterioraban para los japoneses, Anami fue reasignado al teatro del sureste en noviembre de 1943, donde dirigió operaciones en la Nueva Guinea Occidental y Halmahera.

Eventualmente el Emperador Hirohito personalmente solicitó que se diera fin a la guerra.

Falló en realizar el ritual adecuadamente y su cuñado le dio el tiro de gracia.

[3]​ Su nota suicida decía: "Yo - con mi muerte - me disculpo enormemente con el emperador por el gran crimen".

[4]​ Su tumba se encuentra en el cementerio Tama Reien, en Fuchu (Tokio).

Su espada y su uniforme lleno de sangre, así como su nota suicida, están en exhibición en el Museo Yushukan, que se encuentra junto al santuario Yasukuni.