A pesar de sus vínculos familiares, llevó una mala relación con la influyente iglesia católica maltesa porque promulgó una ley para confiscarles bienes sin compensación.
Gracias a ese mensaje, Gadafi y su familia pudieron abandonar la residencia presidencial instantes antes de que fuese bombardeada.
Carmelo Bonnici ejerció como jefe de la oposición desde 1987 hasta 1992, cuando una nueva derrota electoral le llevó a dimitir al frente del Partido Laborista.
El mandatario fue reemplazado por Alfred Sant, un líder más joven con el que Dom Mintoff mantuvo varias disputas.
También se opuso al proyecto de Constitución Europea, pero su moción en el Consejo General del Partido Laborista fue rechazada por los delegados.