Cuando Carlo II murió en 1448, su heredero Leonardo III Tocco intentó buscar la protección de la República de Venecia, tras lo cual los otomanos comenzaron a ocupar los territorios continentales restantes, tomando Arta en 1449.
El último puesto avanzado cristiano en el continente, Naupacto (Lepanto), una colonia veneciana desde 1407, fue conquistada por los otomanos en 1499.
Kâtip también agrega Preveza, pero esto posiblemente sea un error, ya que Evliya no lo menciona.
Luego, la capital se trasladó a la cercana Vrachori, que Evliya describe como una próspera ciudad de trescientas casas durante su visita en 1688.
En consecuencia, desde principios del siglo XVIII en adelante, Karli-Eli fue gobernado por un mütesellim en lugar de un sanjakbey.