También se le denomina Juan de Borgoña el Mozo.
[1] Hay que distinguirlo de otro pintor, llamado también Juan de Borgoña, que trabajó por Toro y Ciudad Rodrigo y nació en el extranjero, como se documenta en el pleito del retablo de Abezames, al que Fiz Fuertes denomina como Juan de Borgoña II.
[2] Para evitar nombres equívocos que sugieran una relación familiar de filiación, parece mejor dejar a este, con Fernando Marías, como Juan de Borgoña el Joven o el Mozo y seguir el criterio del Museo das Peregrinacións de Santiago de Compostela, que atribuye un cuadro de Santiago Apóstol del autor homónimo foráneo a Juan de Borgoña de Toro.
Las noticias referidas a su carrera artística son escasas.
Concluyó algunas de las obras que su padre había dejado inacabadas a su muerte, mostrándose fiel a su estilo de colores fríos e insistencia en el dibujo.