Tras la muerte de la reina Blanca seguirá como canciller y aparece en 1441 como consejero real.
[1] El cargo de prior de la orden del Hospital en Navarra lo obtuvo del Papa en 1435, tras la muerte del anterior prior Martín Martínez de Olloqui, a pesar de no cumplir los requisitos y por el que tuvo que pleitear posteriormente con otro miembro del priorato: Sancho de Echauz.
Con todo, cuando este rechazó la corona, fray Juan de Beaumont, que estaba encargado de la defensa de Villafranca del Panadés rindió la ciudad y se pasó al bando realista en 1464.
Fue enterrado en el convento del Crucifijo en Puente la Reina, el cual había fundado y cuidado.
[1] La tumba hoy en día se encuentra desaparecida.