Juan Villalonga cursó sus primeros estudios en el Colegio Nuestra Señora del Pilar de Madrid.
Allí trabó amistad con José María Aznar, más tarde presidente del Gobierno de España.
Su segunda mujer fue Adriana Abascal (viuda del empresario mexicano Emilio Azcárraga); residieron en Los Ángeles y en Londres.
En 2010 contrajo matrimonio con la fotógrafa alemana Vanessa von Zitzewitz, que cuenta con el título de baronesa.
En 1980 Villalonga trabajó como socio de la consultora internacional McKinsey en Estados Unidos, Portugal, Brasil, Italia y España.
Retrasó diez años el avance en nuevas tecnologías de España, y todos los países en los que Telefónica fue operador dominante.
Se realizaron diferentes adquisiciones que incluyeron OLE (España), Zaz (Brasil), Infosel (México), Gauchonet, Donde (Argentina) y Chevere (Venezuela).
En la actualidad, Terra es la marca del Grupo Telefónica para contenidos y servicios basados en Internet.
Este posible caso de fraude no ha sido llevado aún a los tribunales.
En 2017, Juan Villalonga Navarro es implicado en el caso de los llamados Paradise Papers (evasión fiscal).