[1] Se casó con Juana de Navarra (hija de Carlos III de Navarra) en 1402, que murió en 1413, con la que no tuvo hijos.
[2] Sus segundas nupcias, en 1422, fueron con Juana de Albret (hija de Carlos I, señor de Albret) con la que tuvo dos hijos:[3] Aún casó por tercera vez en el 1435 con Juana de Aragón, hija de Jaime II conde de Urgel, con la que tampoco tuvo hijos, pero el matrimonio ayudó a Juan a recuperar el resto de las propiedades españolas que le debían.
Tuvo además dos hijos bastardos: En 1415 recibió el condado de Bigorra por un acuerdo con Bernardo VII conde de Armagnac.
Al año siguiente fue nombrado gobernador del Delfinado.
En 1434 recibió el gobierno del Languedoc donde pacificó la ciudad de Aviñón que se había rebelado contra el Papa.