Educado por Jorge Espalatino en la corte de Wittenberón en Jena.Fue encargado por su padre de varias misiones diplomáticas, como los tratados con el vecino estado de Hesse en Kreuzburg y Friedewald, así como en la Dieta de Augsburgo, donde se ganó la enemistad del emperador del Sacro Imperio Romano Germánico, Carlos V.Juan Federico sufrió una gran herida en la mejilla izquierda, cuya cicatriz sería a partir de entonces un rasgo distintivo de sus retratos.Mauricio de Sajonia abandonó el bando del emperador en 1552 y se unió a la nueva liga protestante.En septiembre liberó a Juan Federico, que marchó triunfalmente hacia Weimar para hacerse cargo de su ducado.
