Se hizo especialista en cuestiones jurídicas de la Iglesia y llegó a ser apocrisiario y secretario, lo que le pondría en contacto con la corte de Constantinopla.

Cuando el emperador Justiniano, hacia el final de su vida, intentó elevar la secta de los aftartodócetas al estatus de ortodoxia doctrinaria, determinó expulsar a Eutiquio por su oposición, y fue reemplazado por Juan para llevar a cabo la voluntad imperial.

Teodoro Balsamón cita esto sin nombrar al autor en sus notas sobre el primer canon del Concilio Trullano de Constantinopla.

Fabricio considera que la Sinopsis o Armonía y el Nomocanon fueron correctamente asignados a Juan Escolástico.

Siete meses después de su nombramiento, murió Justiniano.