Juan Bautista Mejía y Maguiña fue un militar y político peruano.
Tras la independencia del Perú fue nombrado tesorero general del departamento de Huaylas el 7 de junio de 1823.
Desde ese puesto pudo facilitar los aprestos de la Campaña Libertadora, llegando a obtener el grado de Coronel de Caballería.
Fue miembro del Congreso General Constituyente de 1827 por la provincia de Huaylas.
Dicho congreso constituyente fue el que elaboró la segunda constitución política del país.