Su salto a la política de alto nivel fue como diputado del Parlamento Europeo desde 2004 hasta 2008.
Muscat trabajó regularmente como columnista en l-Orizzont, un periódico en lengua maltesa publicado por la Unión General de Trabajadores y su hermana Sunday semanalmente it-Torca, y fue contribuidor regular en The Times, un periódico independiente publicado en inglés en Malta.
Muscat formó parte de las Nuevas Generaciones del Partido Laborista, las Fórum de las Juventudes Laboristas (Forum Żgħażagħ Laburisti) donde trabajó como secretario financiero (1994-1997) y presidente interino (1997).
Fue miembro de varias delegaciones para las relaciones con Bielorrusia y los países del sureste de Europay miembro del los Comités para la Cooperación Parlamentaria en EU-Armenia, EU-Azerbaiyán y EU- Georgia.
Cuatro meses antes, había sido votado en las Listas del Partido Laborista.
Al asumir el liderazgo del partido modificó el nombre y el emblema de la formación política.
Las últimas frases de Daphne Caruana fueron: “Hay criminales allá donde miras.
[2] El asesinato conmocionó al país y se cuestionaron el funcionamiento de las instituciones.
El magnate Yorgen Fenech detenido por su supuesta implicación en el asesinato apuntó directamente al ya exjefe de gabinete.