[cita requerida] José Javier se casó con Isabel Valdivieso y Carcelén, nieta de Felipe Carcelén, VI marqués de Solanda y VI Marqués de Villarocha.
Dicha convención -al igual que muchas otras- fue célebre por las dificultades que tuvo para elegir Presidente de la República, pues los dos candidatos más fuertes -Antonio Elizalde y Diego Noboa- compartieron varias veces el resultado de las votaciones, hasta que finalmente Elizalde declinó su candidatura y Noboa fue elegido para conducir los destinos de la patria.
Durante su corta administración le correspondió firmar el decreto por medio del cual se declaró a García Moreno «Regenerador de la Patria y Mártir de la Civilización Católica».
Renunció a su cargo y entregó el mando de la República al Presidente del Senado, Rafael Pólit Cevallos; quien presidió las elecciones en las que triunfó Antonio Borrero.
Más tarde se retiró a la vida privada y falleció a finales de 1884.