Los ojeadores peninsulares que tenían las redes echadas en Canarias no dudaron en ficharle para el equipo del Atlético de Madrid quien lo incorpora a sus filas en la temporada 1949-50 .
Su juego combativo admiró a los aficionados madrileños quienes no olvidan las páginas de oro que escribió en el viejo estadio Metropolitano.
En las temporadas 1949-50 y 1950-51 el Atlético madrileño consigue el Campeonato de Liga a las órdenes del "mago" Helenio Herrera.
Memorable partido que la Selección Canaria disputó el 10 de enero de 1950 , al imbatido conjunto argentino del San Lorenzo de Almagro al que venció por 4-2 en el estadio de Chamartín y en el que Hernández “lobito negro”deleitó con su juego junto a otros grandes jugadores insulares que figuraban en los mejores clubes españoles como Silva, Molowny, Cabrera, Gallardo, Rosendo Hernández, Núñez, Durán, escribiendo una página memorable en la historia del fútbol canario.
José Hernández “Lobito Negro” viajó en 1950 a México con los seleccionados españoles que se preparaban para el Mundial de Brasil.