Estudió la carrera de Derecho y posteriormente hizo un posgrado en Recursos Humanos.

En 1999 repitió en las elecciones para obtener un segundo mandato encabezando esta vez una lista conjunto de PNV y Eusko Alkartasuna.

No obtuvo la mayoría absoluta, aunque repitió en la alcaldía, teniendo que llegar a pactos con la oposición para gobernar.

Jauregi está considerado como perteneciente al sector del PNV afín a Joseba Egibar, que resultó derrotada en enero de 2004 frente a la de Josu Jon Imaz en las elecciones internas por la presidencia del partido.

En su lugar fue elegido finalmente Markel Olano candidato del PNV al cargo de diputado general.