Compuso varios himnos a una edad inusualmente temprana, como Lord, Thou host been our refuge («Señor, en ti está nuestro refugio»), Lord, rebuke me not («Señor no me reproches»), y el llamado "himno social", I will always give thanks («Siempre daré gracias»), compuesto en colaboración con Pelham Humfrey y William Turner, posiblemente en honor a una victoria sobre los holandeses, o quizá simplemente para conmemorar la amistad escolar entre los tres coristas.

En septiembre del mismo año se casó con Elizabeth Braddock, que murió en un parto diez años después.

En 1695, fue elegido organista de Santa Margarita en Westminster, y se dice que retomó su trabajo como organista en la Abadía de Westminster del que se había retirado en 1680 para cederle el lugar a su alumno Henry Purcell.

En adición a esta música puramente eclesiástica, Blow escribió Great sir, the joy of all our hearts (Gran Señor, alegría de nuestros corazones) y odas para el nuevo año de 1682, 1683, 1696, 1687, 1688, 1689, 1693, 1694 y 1700.

Otras "crudezas" , donde Burney dice "que se encuentra perdido" (en su crítica), son logros realmente excelentes.