Hasta los 15 años asistió a la escuela latina de Guben.

Luego atravesó Bohemia y Moravia, haciendo una corta parada en Freiberg (Sajonia) antes de dirigirse a Berlín en 1615.

En Berlín, Crüger asistió a una escuela secundaria para prepararse para el estudio de Teología, ganando dinero como tutor.

Una de sus hijas se casó con el pintor de la corte Michael Conrad Hirt, que hizo un retrato suyo.

En 1640 Crüger publicó el más importante libro de himnos religiosos del siglo XVII, el Praxis pietatis melica ("Práctica de la piedad en la canción"), que incluía quince himnos de Gerhardt musicalizados por él.