Hacia 1584 habría sido organista suplente en San Marcos, en ausencia de Claudio Merulo, para en 1585 concursar y ganar el cargo en forma permanente.

También ese año comenzó a trabajar de organista en la Scuola Grande di San Rocco.

Por su parte, compuso diversas obras siguiendo el estilo de su tío pero acentuando aún más los contrastes, con un mayor dramatismo y color.

Hacia 1597 publica su propia colección Sacrae symphoniae que le otorga fama a nivel internacional.

Destaca la Sonata pian e forte en la que, posiblemente por primera vez, se dan indicaciones de dinámica (piano, forte) según las orquestas tocaran solas o juntas.