Su esfuerzo finalmente dio resultado tras conocer a Tom Jobim —pianista y compositor con educación clásica que también gustaba del jazz estadounidense—, con quien empieza a madurar el estilo que se conoció como Bossa nova.

Se atribuye a João Gilberto la creación de este género.

Poco tiempo después João Gilberto grabó su primer disco, llamado Chega de Saudade.

El disco João Gilberto, lanzado en 1973, representa un cambio desde la creación de la bossa nova.

En el disco de 1981, Brasil, João Gilberto trabajó con Gilberto Gil, Caetano Veloso y María Bethania, quienes a finales de los 60 habían creado el movimiento Tropicalismo basándose en la bossa nova y fusionándola con elementos del rock.

Sus años finales estuvieron marcados por problemas monetarios y el declive en su salud.

En 2011, fue demandado y desalojado de un departamento en Leblon por su dueña, la Condesa Georgina Brandolini d'Adda.

Esto fue reportado en diciembre del 2017 hasta que su hija Bebel (Isabel) tomó el control de sus finanzas alteradas por el deterioro mental y su gran endeudamiento.