Este derivado es reactivo frente a nucleófilos, incluyendo grupos amina y sulfhidrilo de proteínas.
Las moléculas orgánicas pequeñas como FITC forman una unión covalente con grupos amino libres en anticuerpos.
Este método creado por Coons y colaboradores sentó las bases de la inmunohistoquímica actual.
Los cortes de tejidos y monolayers celulares pueden teñirse con FITC según diversos métodos.
La emisión máxima se realiza a los 518 nm, en la región verde-azulada del espectro, color que puede modificarse al introducir filtros amarillos.