El relevó Josep Maria Monfort y Bolívar, que fue director de 2008[3] a 2018.
Desde julio de 2018 ocupa el cargo el Dr. Josep Usall y Rodié.
[4] La estructura científica del IRTA consta de 5 áreas de investigación fundamentales: Industrias Agroalimentarias, Producción Vegetal, Producción Animal, Medio Ambiente y Cambio Global y Economía Agroalimentaria.
Genética y Mejora Animal Acuicultura Sanidad Animal Esta área cuenta con cinco programas: Gestión Integral de Residuos Orgánicos, Ecosistemas Acuáticos, Horticultura Ambiental, Producción Ecológica y Bioenergía y Uso Eficiente del Agua.
Gestión Integral de Residuos Orgánicos Ecosistemas Acuáticos Horticultura Ambiental Producción Ecológica y Bioenergía Uso Eficiente del Agua Esta área cuenta con dos programas: Economía agroalimentaria y Economía de los recursos naturales y desarrollo agroalimentario.