Pianista de formación, estudió dirección orquestal con Franco Ferrara.

Perteneció al conjunto de música contemporánea Ensemble Modern, donde comenzó como pianista y llegó a ser su director permanente en 1985.

Nombrado director asistente del teatro La Monnaie de Bruselas, dirigió aquí numerosas obras líricas.

Como director sinfónico también ha aparecido con las principales orquestas de Viena, París, San Petersburgo, Roma, Berlín, etc.

Metzmacher ha efectuado prestigiosas grabaciones de música contemporánea.