Tras su paso por varios equipos europeos finalizó su carrera en 1997 en las filas del FC Sion de la Superliga Suiza, a los 33 años.
El Vardar vivió su época dorada, formando también parte de aquella plantilla Darko Pančev, Vujadin Stanojković y Dragan Kanatlarovski.
Najdoski fue un habitual en las alineaciones esa temporada, y formó parte del equipo que ganó la final al Olympique de Marsella junto a Stevan Stojanović, Miodrag Belodedici, Refik Šabanadžović, Vladimir Jugović, Slobodan Marović, Siniša Mihajlović, Dragiša Binić, Dejan Savićević, Robert Prosinečki y Darko Pančev.
El equipo consiguió el ascenso, y Najdoski disputó 23 partidos marcando dos goles,[4] en sendos lanzamientos de falta.
Najdoski se alineó en 31 partidos en la máxima categoría del fútbol español,[5] pero a final de temporada, y con 30 años cumplidos, el defensa dejó el club.