Hermano de Francisco Javier Mariátegui y Tellería, destacado político liberal.

A bordo de la fragata Resolución participó en la captura del bric chileno Maipú, que fue conducido como presa al Callao (1818).

Pero luego se unió al Ejército Libertador que estaba al mando del general José de San Martín, siendo reconocido como alférez de fragata en la flota chilena.

Libre ya el Perú de dominaciones extranjeras, Mariátegui continuó sirviendo en la marina peruana.

Ofendido por el hecho de que lo usasen como carcelero, desembarcó en dicho puerto y envió de retorno al vapor, solicitando su retiro del servicio.

El gobierno del general José Rufino Echenique (1851-1855) lo reincorporó como comandante de la goleta Libertad.