La iglesia corresponde al modelo tradicional de templo manierista jesuítico, con una amplia nave de tres tramos con crucero y capillas laterales intercomunicadas.
La nave está cubierta por una bóveda de cañón y el tramo central del crucero culmina en una cúpula.
Las reformas efectuadas en el siglo XVIII le dieron su actual aspecto barroco, con pilastras cajeadas con capiteles compuestos y cornisa perimetral, así como las ornamentaciones de yeserías y la cúpula decorada al fresco.
El antigo colegio de los jesuitas en la actualidad es el Centro Cultural Castel Ruiz.
En 1749 fue restaurada la capilla, transformando las primitivas decoraciones manieristas en barrocas.