Luego pasó a la Universidad de Texas en Arlington donde volvió al jardín.Bateo .347 en su segundo año que fue en el 2003 y fue nombrado primer equipo All-Conference como jardinero.Pence todavía lleva a cabo el récord de conferencia en dobles en una sola serie, con 5.Jugó la temporada 2004 con los ValleyCats Tri-City, Un equipo de ligas menores con sede en Troy, Nueva York.En 2006, con la AA Corpus Christi Hooks, Pence bateó para .283 y conectó 28 jonrones con 95 carreras impulsadas.En 2006, él era uno de los tres jardineros con nombre para la revista Baseball America Minor League All-Star Team.Pence fue una selección unánime para el premio Topps Novato de la Major League All-Star Team.Pence (15 puntos) quedó en tercer lugar, y perdió ante Braun (128 puntos) en la votación para el Novato 2007 NL Sporting News del Año Premio por 488 jugadores de Grandes Ligas y gerentes 30.En la receso del Juego de Estrellas, estaba bateando para .321 Pence, con 10 jonrones 59 carreras impulsadas.
