[1]​ Existen dos subtipos de HHV-6, denominados HHV-6A (el virus linfotrópico B humano) y HHV-6B (relacionado con la roseola infantil).

Tales infecciones usualmente causan fiebre, con en el 10% de los casos exantema súbito (roseola, erupción).

[3]​ Las infecciones primarias por HHV-6 cuentan hasta el 20% de las hospitalizaciones infantiles en los Estados Unidos[4]​ y se asocian con varias complicaciones más graves, como encefalitis, linfadenopatía, miocarditis y mielosupresión.

En la mayoría de los casos, estas re-activaciones a menudo son asintomáticas, pero en individuos inmunodeprimidos puede haber complicaciones graves.

El HHV-6 también ha sido encontrado en pacientes de esclerosis múltiple[6]​ e implicado como cofactor en varias otras enfermedades, incluyendo el síndrome de fatiga crónica,[7]​ fibromialgia, sida,[8]​ y epilepsia del lóbulo temporal[9]​ pero todavía no se ha establacido el vínculo definitivo.