El centro de la ocupación romana era Aventicum (Avenches), otras ciudades que se fundaron fueron Arbor Felix (Arbon), Augusta Raurica (Kaiseraugst, cerca de Basilea), Basilea, Curia (Coira), Genava (Ginebra), Lousanna (Lausana), Octodurum (Martigny, controlando el paso montañoso del Gran San Bernardo), Salodurum (Soleura), Turicum (Zúrich) y otros lugares.
El imperio romano consiguió recuperar el Rin como frontera, y las ciudades de la zona se reconstruyeron.
Los primeros obispados se fundaron en los siglos IV y V en Basilea (documentado en 246), Martigny (doc.
Los burgundios lo hicieron en el Jura, el Ródano y en los Alpes al sur del lago Ginebra; mientras que en el norte los colonos alamanes cruzaron el Rin en 406 y asimilaron lentamente a la población galaico romana, o les hicieron retirarse a las montañas.
Los reyes burgundios trajeron el cristianismo fundando nuevos monasterios, como en Romanmôtier o en Saint Maurice en el Valais en 515.
Los monjes irlandeses Columbanus y San Gall re introdujeron la fe cristiana a principios del siglo VII.
Bajo el gobierno de los reyes carolingios proliferaron los monasterios y obispados; pasaron a ser importantes bases para mantener el poder.
El Fraumünster se encuentra cruzando el río desde el Grossmünster, que de acuerdo con la leyenda fue fundado por el mismo Carlomagno, pues su caballo cayó sobre sus rodillas justo donde los mártires Félix y Régula fueron enterrados.
Federico II otorgó la Inmediación Imperial (Reichsfreiheit) a Schwyz en 1240 en el Freibrief von Faenza para situar el paso bajo su control directo; su hijo y durante algún tiempo corregente, Enrique VII, había otorgado los mismos privilegios anteriormente al valle de Uri en 1231 (mediante el Freibrief von Hagenau).
Consecuentemente, los Habsburgo lograron en unas pocas generaciones extender su influencia a por Suabia en el sudeste de Alemania hacia Austria.
Como rey, finalmente pasó a ser el señor feudal directo de las «Comunidades del Bosque» (Waldstätten, Uri, Schwyz y Unterwalden), que vieron recortada su independencia anterior.