Gymnogeophagus mekinos es una especie de pez de agua dulce que integra el género Gymnogeophagus, de la familia de los cíclidos.

Habita en el centro-este de América del Sur.

Esta especie fue descrita originalmente en el año 2015 por los ictiólogos Luiz Roberto Malabarba, Maria Claudia de Souza Lima Malabarba y Roberto Esser dos Reis.

[1]​ Pertenece al clado denominado Gymnogeophagus grupo gymnogenys.

[1]​[2]​[3]​ Se distribuye en el Uruguay y en el centro-sur del estado brasileño de Río Grande del Sur; habita en cursos fluviales templados a subtropicales de la cuenca del río Negro, la cual es parte de la del río Uruguay, el que pertenece a la cuenca del Plata.