[6]​[7]​ En ese entonces el secuestro y fuga fue calificado por Alberto Santofimio como una farsa publicitaria.

[9]​ Para las elecciones locales de 1992 apoyó la candidatura de Ramiro Lozano Neira, quien al final no incluyó a Jaramillo pues según Neira, Jaramillo le exigía que ratificara a la gerenta de la Beneficencia, Marta Esperanza Ramos Echandía,[10]​ contra la cual cursaban varias investigaciones administrativas.

[11]​ Fue crítico del gobierno de César Gaviria porque, según Jaramillo, el presidente Gaviria había discriminado a los sectores liberales que no lo acompañaron en la consulta interna de su partido.

Estos equipos, capacitados previamente con orientaciones técnicas, operativas, con sentido humanizado, alto respeto, solidaridad, efectúan acciones dirigidas a la identificación de las familias más vulnerables clasificándolas en alto, medio y bajo riesgo para priorizar las intervenciones.

[cita requerida][16]​ La Procuraduría le formuló pliego de cargos por haber nombrado como gerente del Hospital de Meissen a Luz Marina López Salamanca, quien supuestamente estaba inhabilitada para ocupar el cargo.

Renunció en el 2014 para promover a no revocatoria del mandato de Gustavo Petro.

Gerente de campaña de las listas del Pacto Histórico al congreso En 2022 para la campaña presidencial y del congreso las fuerzas alternativas de Colombia se unieron en una coalición llamada Pacto Histórico en donde Guillermo Alfonso Jaramillo fue nombrado gerente para la lista al congreso y Ricardo Roa gerente para la consulta presidencial que contó con cinco candidatos.

[23]​ Ha sido fuertemente criticado porque como gobernador del Tolima separó el Conservatorio de música del Tolima del colegio Amina Melendro, lo que debilitó el proceso como ciudad musical tanto que aún no se ha podido recuperar ninguno de los dos ejes culturales de Ibagué.

Con eso, se quería lograr que esa zona del país fuera nombrada territorio de paz y, luego, propiciar los diálogos nacionales con las FARC-EP.

[30]​ El juzgado séptimo penal del Circuito condenó a siete años de prisión al asesor de Guillermo Alfonso Jaramillo, Augusto Hernando Arias Cruz, por sus nexos con las FARC-EP.

[31]​ Guillermo Alfonso fue candidato a la Alcaldía de Ibagué para las elecciones locales en 2015 por el MAIS (fundado por Juvenal Arrieta,[32]​ concejal del municipio de Ciudad Bolívar, Antioquia) y el Polo Democrático.

[35]​ En 2007 Jaramillo fue acusado por el desmovilizado Raúl Agudelo Medina alias Ovidio Saldaña de supuestamente sostener reuniones con las FARC-EP y contactos con alias 'Jerónimo', un cabecilla de esa organización en el Tolima.

[40]​ La Contraloría Departamental abrió un proceso para establecer si la esposa de Guillermo Alfonso y sus hijos han estado utilizando tiquetes aéreos pagados con dineros del departamento.

Poco después, pasó la respectiva cuenta de cobro a la Tesorería departamental, que autorizó su pago.

Se trató del número 0350021229441, en clase Y, en la ruta Ibagué-Bogotá con un costo de 96.000 pesos.

Este proyecto recibió críticas como las del toxicólogo Camilo Uribe Cualla calificó esa sustitución como un "exabrupto".

En la contienda a la alcaldía de Ibagué en un debate con el candidato Emmanuel Arango frente a estudiantes de colegio, Jaramillo argumentó que no consideraba malo que los jóvenes se fumaran un porro.