[a]​ El priorato estaba adscrito a la denominada lengua de Aragón donde estaban incluidos los dos junto con el Gran Priorato de Navarra y, hasta 1462 en que se separaron, también se incluyeron en esta lengua Castilla, León y Portugal.

El Priorato de Cataluña comprendía prácticamente todas las encomiendas situados en Cataluña (incluidos los condados del Rosellón) y las Islas Baleares.

Sin embargo, las encomiendas situadas al sur del Ebro permanecían incluidas en la Castellanía de Amposta.

Sin embargo, hubo excepciones: antiguas posesiones templarias de La Litera y, sobre todo, las sanjuanistas de la Baja Ribagorza, adscritas a la encomienda de Siscar permanecieron bajo la administración del Gran Priorato de Cataluña.

Al frente del Priorato de Cataluña había un fraile hospitalario que residía normalmente en Barcelona y durante la Edad Media solía ser una persona de la confianza real, como sucedía con el castellano de Amposta.