El Gran Premio de Portugal de Motociclismo de 2003 (oficialmente Grande Prémio Marlboro de Portugal) fue la undécima prueba del Campeonato del Mundo de Motociclismo de 2003.

Tuvo lugar en el fin de semana del 5 al 7 de septiembre de 2003 en el Autódromo do Estoril, situado en Estoril, Portugal.

La carrera de MotoGP fue ganada por Valentino Rossi, seguido de Max Biaggi y Loris Capirossi.

Toni Elías ganó la prueba de 250 cc, por delante de Manuel Poggiali y Randy de Puniet.

La carrera de 125 cc fue ganada por Pablo Nieto, Héctor Barberá fue segundo y Alex de Angelis tercero.