[3] El ganador final fue Joaquim Rodríguez por delante de Alejandro Valverde[2] que en principio obtuvo el segundo puesto pero fue desclasificado como consecuencia del Caso Valverde (ver sección Alejandro Valverde y la Operación Puerto) por lo que el segundo fue Michel Kreder seguido de Aleksandr Kolobnev (finalmente tercero).
[3] En las clasificaciones secundarias se impusieron Javier Ramírez Abeja (montaña y sprints especiales), Adrián Sáez de Arregi (metas volantes), Jorge Azanza (combatividad), Euskaltel-Euskadi (equipos) y Juan José Oroz (navarros).
[2] A pesar de que Alejandro Valverde no diese positivo en esta carrera ni en las anteriroes durante el año, el 30 de mayo la UCI, a instancias del TAS, decidió anular todos los resultados del ciclista español durante el 2010 debido al Caso Valverde.
[5] Por lo tanto oficialmente Valverde fue desclasificado de la carrera navarra con la indicación "0 DSQ" (descalificado), aunque indicando el tiempo con el que había acabado la carrera, en la que finalizó segundo.
Esta sanción también tuvo incidencia en el UCI World Ranking ya que sus puntos pasaron a otros corredores reestructurándose así no solo la clasificación individual sino la de por equipos y la de por países,[6] aunque esta carrera no pertenecía a dicho circuito y Valverde no aspiraba a puntuación.