La decoración del interior no comenzó hasta unos años más tarde: Rastrelli presentó un dibujo aprobado para la “decoración pictórica y de estuco” de la iglesia en 1759 .

Según su decisión, no se correspondía ni con el antiguo esquema de cúpulas cruzadas en cruz griega ni con el tipo de basílica del templo.

El arquitecto crea un único interior similar a un salón de palacio.

Las cúpulas fueron pintadas por los italianos K. Zucchi y F. Martini, la parte del altar - D. veneroni; moldura - j. B. Jani.

Los evangelistas en velas y el plafón "La Resurrección de Cristo" en el vestíbulo fueron pintados por F. Fontebasso .

Después del catastrófico incendio de 1837, el arquitecto Vasily Stasov se esforzó por restaurar la iglesia de la familia imperial "con posible precisión <...> en su forma anterior", aunque se necesitaron pocos dibujos para ello.

El iconostasio, el dosel y el púlpito dorados fueron tallados según los dibujos del arquitecto por el maestro P. Cretense.

Algunos de los íconos guardados durante el incendio regresaron a sus lugares.

Las Puertas Reales, junto con seis pintorescos medallones (iconos), sobrevivieron al incendio de 1837.

Fueron rescatados y tras la restauración del palacio fueron devueltos a su lugar en el iconostasio renovado.

El último rector de la iglesia y al mismo tiempo a cargo del clero de la corte fue el protopresbítero Alexander Dernov, quien fue designado para este cargo en 1915 .