[5] Como investigadora, Trujillo participó en proyectos nacionales e internacionales, como grupo de investigación financiado por el Programa Uses of the Past de la red de financiación Humanities in the European Research Area (HERA) y por el Programa Horizonte 2020 de la Unión Europea denominado CRUSEV-Cruising the Seventies: Unearthing Pre-HIV/AIDS Queer Sexual Cultures[6] y ha sido asesora para España en el proyecto financiado por el ERC, Intimate- Citizenship, Care and Choice.
The micropolitics of intimacy in Southern Europe.
[7][8][9] Trujillo es una reconocida activista lesbiana, feminista y queer en España.
Ha sido cofundadora e integrante de varios colectivos feministas queer, como el Grupo de Trabajo Queer (GTQ), la asamblea Transmaricabollo del Movimiento 15-M y el Orgullo Crítico.
[12] En 2009, el blog Dos manzanas distinguió su libro Deseo y resistencia (1977-2007) Treinta años de movilización lesbiana en el Estado español con el Premio Desayuno en Urano de Ensayo.