Tuvo un papel significativo en los acontecimientos de Sicilia de 1647, participando activamente en el apaciguamiento de varias rebeliones populares, acciones por las que fue felicitado por el rey en varias cartas.Descubrió y combatió una tentativa francesa de invasión, participando a Pedro Fajardo y Pimentel, marqués de los Vélez, virrey de Sicilia.Fue nombrado Cabeza del Parlamento de Sicilia por el presidente del reino, el cardenal Gian Giacomo Teodoro Trivulzio, siendo virrey el marqués de los Vélez.En 1649, siendo nuevamente cabeza del parlamento, dio a Juan José de Austria treita mil reales de plata para el apresto de la Armada.En 1655, quando Luis José, duque de Guisa tomó la isla de Favignana en Sicilia y Castelamar en Nápoles, Giovanni IV se enfrentó a él, ocupando los cargos de cabo y general de la caballería de las milicias regulares, siendo capitanes de ellas los títulos más preeminentes del reino.