Se preparó para el sacerdocio estudiando Filosofía en Bwamanda y Teología en el Institut Saint Eugène de Mazenod.

También se unió a la Orden de los Hermanos Menores Capuchinos (O. F. M.

Más tarde estuvo durante una temporada en Roma para obtener una licenciatura en Teología moral católica por la Academia Pontificia Alfonsiana.

Tras su ordenación sacerdotal comenzó a ejercer como párroco en la población de Bobito.

[2]​ También durante esa época se desempeñó como Superior Mayor y Viceprovincial en su orden para la viceprovincia congoleña, fue presidente de ASUMA y CONCAU (asociaciones regionales de capuchinos en África) y del comité "Cri du Pauvre" de los capuchinos en Roma.

Fridolin Ambongo Besungu está acusado de comentarios sediciosos que constituyen “rumores falsos, incitación a la rebelión de la población y ataques contra vidas humanas”.