Se conoce que nació en Bulbuente sobre el tercer cuarto del siglo XVI, y que tenía tres hermanos, dos hermanas fallecidas y su hermano Miguel Lamberto Navarro de Eugui, ya que consta en el testamento dictado en mayo de 1607.

[1]​[2]​ Durante su mandato él se quedó ciego, y tuvo que solicitar asistencia al rey Felipe IV y al papa Urbano VIII, de un coadjutor, que recayó en su sobrino Pedro Miguel de Balsorga, que tenía derecho a sucesión en el cargo, aunque este falleció en 1635.

En 1639 Urbano VIII nombró a Esteban de Esmir como coadjutor y sucesor.

Esta capilla quedó en abandono pronto, ya que no tenía uso, aunque existía una capellanía laica formada por familiares del párroco, que mandaban hacer tres misas semanales.

Los padres y abuelos de Francisco están enterrados en esa capilla según consta en su testamento.