Francisco Montealegre Fernández fue un político y empresario costarricense.
Fue hijo de Mariano Montealegre Bustamante y Gerónima Fernández Chacón.
De regreso en Costa Rica participó activamente en la vida empresarial.
Durante la primera fase de la guerra contra los filibusteros de William Walker fue edecán del Presidente Juan Rafael Mora Porras, junto con su hermano Mariano Montealegre Fernández.
Aunque se encontraba ausente del país en 1859, cuando se produjo el golpe militar que derrocó a Mora y llevó al poder a su hermano José María Montealegre Fernández, durante el gobierno constitucional de éste (1860-1863) tuvo una importante participación política, ya que fue Secretario de Hacienda y Comercio y Designado a la Presidencia.