Francisco Cantera se licenció en Derecho en la Universidad de Valladolid, y en Filosofía y Letras en la Universidad Central de Madrid.
Su trabajo hizo despertar el letargo al que se tenía sometido a los estudios hebraicos en España.
En colaboración con J. M. Bover tradujo la Biblia, haciéndose cargo Cantera Burgos de la traducción del Antiguo Testamento.
Esta traducción de la Biblia apareció en 1947 y es su obra más conocida.
Cumpliendo la voluntad de su testamento, se fundó, al año siguiente, la institución que lleva su nombre en Miranda de Ebro.