Por parte materna eran sus abuelos Vladislao II el Desterrado, Gran Duque de Polonia y su esposa Inés de Babenberg, hija del margrave de Austria Leopoldo III.

Fueron sus hermanastros los reyes Fernando II de León y Sancho III de Castilla, nacidos del primer matrimonio de Alfonso VII el Emperador con la reina Berenguela de Barcelona.

El infante Fernando nació en el año 1153, siendo el primogénito de los hijos habidos entre Alfonso VII el Emperador y su segunda esposa, Riquilda de Polonia.

[2]​ Los restos del infante Fernando de Castilla yacen en un sepulcro, colocado a modo de hornacina en el lado del Evangelio del presbiterio de la iglesia del Monasterio.

La urna sepulcral es moderna y sobre ella se encuentra una pequeña estatua que representa al infante Fernando, estando colocada bajo ella una inscripción, que sustituyó a otra anterior, en la que aparece el siguiente epitafio con su traducción al castellano.