Actividad emblemática del MNHN, fue creada por la directora Grete Mostny, se realiza desde 1970 y es la más antigua de su tipo en Latinoamérica.
Ésta era una organización dedicada a la práctica científica en niños y jóvenes, en una modalidad de educación no formal.
Las Juventudes fueron creadas en 1967 por la doctora Grete Mostny, en ese entonces directora del MNHN, quien observó modelo de enseñanza en Europa, en los años posteriores a la Segunda Guerra Mundial.
Además, Germán Pequeño conoció las experiencias de las Juventudes Científicas belgas, lo que lo motivó a replicar la iniciativa en Chile.
Ese año comenzó la realización de eventos en paralelo con esta entidad, como el Seminario sobre Actividades Científicas Juveniles que se llevó a cabo a la par de la X Feria Científica.
Además, en 1988 la feria trasciende las fronteras chilenas, puesto que la Fundación Andes premia con pasajes a la Feria Internacional de Ciencia y Tecnología, que se realizó en Blumenau, Brasil, donde competían proyectos de Física, Química y Biología.