Se basaba en la colección iniciada por el Príncipe Charles Alexander de Lorena, que databa del siglo XVIII.
Bernard du Bus de Gisignies, fue su primer director en 1846.
Para esta ocasión, donó 2474 pájaros de su propia colección al museo.
El museo también obtuvo esqueletos de ballena boreal (Balaena mysticetus) y una joven ballena azul (Balaenoptera musculus), las cuales aún se muestran en el museo.
En ese momento el único esqueleto de mamut expuesto al público se encontraba en San Petersburgo (Rusia).