Esta organización surge al calor de las reformas universitarias desarrolladas en América.

Está afiliada a la Organización Continental Latinoamericana y Caribeña de Estudiantes (OCLAE).

La FEU surge en un contexto de grandes tensiones políticas en América con claras manifestaciones en las universidades.

El primer turno en la presidencia le tocó ocuparlo a Felio Marinello, un ferviente luchador por la Reforma Universitaria, como secretario, electo como general beneplácito, designaron a Julio Antonio Mella, uno de los más destacados dirigentes quien fue asesinado el 10 de enero de 1929 en México.

Ese mismo año Rolando Cubela y Pedro Luis Boitel son arrestados por el gobierno.