[2]​ Comenzó a funcionar en marzo de 1889 con dos profesores médicos, y el curso comprendía los estudios de anatomía patológica, fisiología, terapéutica dentaria, cirugía y clínica dentaria, distribuidos en dos años.

Los aspirantes a la Escuela debían haber finalizado sus cuatro primeros años de humanidades, y, para la obtención del título, debían rendir un examen frente a profesores del curso y tres docentes de la Facultad de Medicina.

[3]​ En 1898 el decano Ventura Carvallo envió a su ayudante en la cátedra de cirugía Germán Valenzuela Basterrica a seguir un curso para especializarse en la Escuela Dental de París.

La intervención del director Germán Valenzuela Basterrica, quien realizó pericias odontológicas a los restos encontrados, permitieron resolver el crimen de la legación alemana y delatar al culpable.

Guillermo Beckert, quien había simulado su propia muerte y asesinado a Tapia, fue capturado cuando intentaba escapar del país.

[1]​[2]​[6]​ Para agradecer la labor en la resolución del caso y en la pacificación de las relaciones con Alemania, el gobierno del presidente Pedro Montt le ofreció una recompensa a Valenzuela Basterrica, quien solicitó la construcción de un edificio para la Escuela Dental.

[8]​ Junto a las modificaciones del plan de estudios, se comenzó la renovación del edificio en que funcionaba la Escuela Dental, y se adquirieron nuevos útiles y material de enseñanza.

[11]​ La clínica odontológica funciona en un edificio propio ubicado en la esquina de la calle Olivos y avenida La Paz desde 2007, año en que se trasladó desde el edificio de avenida Santa María.