Eureka tiene un clima templado muy suave con fluctuaciones de temperatura muy pequeñas entre el verano y el invierno.
Esto se debe a la fresca corriente de California, cuya temperatura del agua oscila entre 11,7 °C y 16 °C durante todo el año.
Bajo la clasificación climática de Köppen, Eureka tiene un clima mediterráneo oceánico (Csb), debido a las escasas precipitaciones durante el verano.
[2][3] Las temperaturas medias de verano en Eureka son mucho más frías que en la ciudad de Nueva York y Estambul, que se encuentran en la misma latitud.
La nieve es particularmente rara y cae como máximo una o dos veces por década.