[nota 1]​ La estación se encuentra a 246 metros de altitud.

[nota 2]​ Hay que destacar que esta línea no pasó a manos de RENFE en 1941 por no ser de ancho ibérico (1668 mm).

[15]​ Frente al andén del edificio de viajeros discurre la vía principal y más allá la derivada, ya desconectada de la red y con acceso al segundo andén lateral no practicable.

Los trenes regionales que realizan el recorrido Santander - Bilbao (línea R-3f) tienen parada en esta estación.

Los servicios ferroviarios en Villaverde Trucios en la relación Bilbao-Santander, para los trayectos regionales, se prestan exclusivamente con composiciones diésel de la serie 2700[18]​