La enfermedad fue importada a Malta por galeras toscanas que habían capturado embarcaciones de Alejandría.
En el momento del brote, Malta estaba gobernada por la Orden de San Juan.
Las epidemias se habían producido en 1427-1428 y 1523, con esta última confinada a la ciudad de Birgu.
[3] La epidemia de peste que comenzó en 1592 llegó a Malta indirectamente desde Alejandría, en Egipto, gobernado por los otomanos.
[3] Estas medidas se aplicaron con duras penas, incluyendo flagelación y muerte.
[6] Lugares de lavado cerca del mar se establecieron en La Valeta, Birgu y Senglea permitiendo que los casos sospechosos se lavan en un intento de purificarse a sí mismos y su ropa.
Este fue el primer caso registrado en que tales cementerios se establecieron en Malta,[9] y también se establecerían otros similares en brotes importantes posteriores de la enfermedad, como en 1675-1676[5] y 1813-1814.
Otros dos brotes se producirían en Malta, gobernada por los hospitales, un brote limitado en 1655 que mató a 20 personas[5] y una epidemia masiva en 1675-1676 que mató a unas 11.300 personas, una parte considerable de la población de la isla.