[1][2] Dos de sus hermanos mayores, Hugo y Eudes I, heredaron el ducado.
[2] No existe ningún registro contemporáneo donde conste el nombre de su madre.
[4] Sin embargo, esta hipótesis es problemática ya que el hermano de Enrique, Eudes I había casado con la hermana de Raimundo de Borgoña y, aunque los matrimonios entre parientes cercanos era permitida con la debida dispensa papal, los matrimonios entre primos hermanos estaba prohibida y es probable que el parentesco entre Eudes I y su esposa Sibila fuese más lejano.
[11] Mediante este pacto, que contaba con el visto bueno del pariente de ambos, el abad Hugo de Cluny,[a] Raimundo «prometía bajo juramento a su primo Enrique entregarle el reino de Toledo y un tercio del tesoro regio cuando muriera Alfonso VI».
Enrique de Borgoña, aprovechando los problemas, conflictos familiares y políticos surgidos en torno a su cuñada la reina Urraca, declaró la independencia del Condado de Portugal.
Ocuparon puestos eclesiásticos y políticos relevantes lo que causó una fuerte reacción en contra durante los últimos años del reinado de Alfonso VI.